La consulta inicial de la mayoría de las técnicas naturopáticas durará aproximadamente 1 hora con el fin de que pueda realizarse una evaluación completa del estado general de salud. Cada consulta se basa en la flexibilidad y la individualidad, ya que los naturópatas no intentan averiguar «lo que está mal en el cliente» si no «porqué está mal’. De esta manera, el usuario es examinado como un todo y no como partes individuales.

__Se puede prestar especial atención, a la dieta, el estilo de vida, aspectos ambientales y emocionales, en función de la técnica, con el fin de establecer una relación con el entorno y funcionamiento del cliente__

Por otra parte, el cuestionario de antecedentes familiares se realiza únicamente si existiera necesidad.

En función de la técnica naturopática, puede realizarse un examen físico y, en ocasiones, se pueden usar algunas herramientas como Iridología o Kinesiología para ayudar con la evaluación. Las recomendaciones y supervisión del progreso del cliente serán documentados, valorados y analizados en futuras intervenciones naturopáticas, si fuesen necesarias.